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利用敦煌文献研究宗教史，在这一阶段也取得了不少重要成果。李正宁瞰煌地区古代们届寺观简志民《敦煌学辑刊》1988年1、2欺），依据敦煌文献及其2有关记载全面考察了敦煌地区古代出现过的每座调庙、道观和佛寺的基本情况，奠定了进一步研究敦煌宗教史的基础。杨富学《佛教在回田中的传播》（《庆祝活石禅先生九秩华诞敦煌学诗刊》），利用敦煌文献结合其它资料探讨了佛教在回码中的兴衰情况．荣新江考察了九、十世纪敦煌佛教的盛衰概况，并在日本学者研究的基础上对归义军时期部分都增统的年代和事迹进行了考证（《归义军史评究认谢重制吐盲占领期与旧义军时期的敦煌增官制度》（《敦煌研究》1991年3期），考察了吐着归义军时期敦煌的增它系统和增富活动的世俗化倾向；快于唐后期五代间沙州专院经济的几个问题》，对沙州寺院的等级结构和专院经济的经营内各、特点等问题进行了初步探讨、美伯勒《唐五代敦煌寺户制度》（中华书局门987年）及相关系列论文，虽以研究敦煌寺户制的各种表现形态及其衰落演变为中心，实际考察的范围轻涉到敦煌佛教史的诸多方面；而作者的立意则在于将此课题研究作为解剖部由前户制度衰落时中国封建社会经济结构变迁的一把钥匙。张弓《唐五代敦煌寺院的牧羊人》（《兰州学刊》1984年2期），对敦煌寺院牧羊人的身份进行了考察。唐耕耦《敦煌寺院会计文书研究》（新文丰出版公司，1997年）及相关论文，对敦煌寺院入破历、常住什物历等会计文书做了缀合、复原和研究。郝春文《唐后期五代宋初沙州僧尼的特点》、《唐后期五代宋初沙州的方等道场与方等道场司》（《唐研究》2卷，1996年）、《唐后期五代宋初沙州僧尼的宗教收入》（《段文杰敦煌研究五十年纪念文集》，世界图书出版公司，1996年）等系列论文，对前人关注不多的沙州僧尼的出家、受戒、生活状况、宗教活动与宗教收入等进行了系统考察。姜伯勤《敦煌艺术宗教与礼乐文明》（中国社会科学出版社，1996年）"宗教篇"及相关论文，探讨了禅宗在敦煌的流传、律宗在敦煌的传承及敦煌佛教的中国大乘佛教特色等。方广錩《佛教大藏经史》（中国社会科学出版社，1991年）及相关论文，将敦煌文献中的资料与传世资料、金石资料结合起来，系统考察了汉文大藏经的形成、发展过程。并探讨了沙州从中原乞经的情况。郭朋《坛经校释》（中华书局，1983年），是国内第一部对敦煌写本《坛经》进行录校、注释的著作。杨曾文《敦煌新本六祖坛经》（上海占籍出版社，1993年），首次对敦煌市博物馆收藏的《坛经》进行了录校。但两书的录文都不够完善。潘重规《敦煌坛经新书》（佛陀教育基金会，1994年），以影写的方式对《坛经》重新做了录校。邓文宽《大梵寺佛音--敦煌莫高窟（坛经）读本》（如闻出版社，1997年），用敦煌学方法对坛经进行了整理。杜斗城《敦煌本（佛说十王经）校录研究》（甘肃教育出版社，1989年）及相关论文，对反映敦煌地区宗教信仰、风俗习惯和民间生活的《佛说十王经》进行了录校，并着重对该件涉及的地狱问题做了探讨。道教史方面，姜伯勤《敦煌艺术宗教与礼乐文明》"宗教篇"及相关论文，讨论了敦煌的中国道教精神。刘屹《敦煌十卷本 《老子化相经》新探》（《唐研究》2卷，1996年），将士卷本现存的四个残卷作为一个整体来考察，并探讨了《化胡经》的发展与李唐皇室的关系。摩尼教史方面，以林悟殊取得的成就最大。他有关这一课题的系列论文，对敦煌本汉文摩尼教残经进行了缀合、定名、定年和细致的校勘，并对摩尼教入华年代应在唐以前的说法做了充分的论证。他有关这一课题的中文论文大多被收入《摩尼教及其东渐》（中华书局，1987年）和《古代摩尼教艺术》（淑馨出版社，1995年）两书中。姜伯勤《敦煌白画中的粟特神祇》（《敦煌吐鲁番学研究论集》），成功地考辨出敦煌白画中的持犬女神和持日月蛇蝎女神都是与祆教有关的粟特神祇。